Петрозаводский государственный университет - один из ведущих многопрофильных научных центров Северо-Запада России. Основная научная деятельность вуза сосредоточена в приоритетных направлениях научно-инновационно-образовательной деятельности: инженерные науки и высокие технологии, в том числе информационно-коммуникационные и нанотехнологии распределенных и высокопроизводительных вычислений и систем, биоинформатика, математическое моделирование сложных систем, приборостроение, новые материалы и др.; медико-биологическое, включая новые средства генодиагностики инфекционных, наследственных, аутоимунных, мультифакторных и опухолевых заболеваний, исследования стволовых клеток, новые методы транспортировки лекарственных агентов в организме, разработку методов направленного химического воздействия на ДНК и РНК, молекулярно-биологические исследования причин различных заболеваний и др.; рациональное природопользование и другие направления. Материально-техническая база университета с высокотехнологичным оборудованием позволяет проводить комплекс специализированных научных исследований и разработок.

Сотрудничество университета и СЗЦТТ планируется в рамках реализации совместных проектов по направлениям: сенсоры и сенсорные системы, фотоника, оптика, функциональные покрытия, тонкопленочные технологии, редкоземельные металлы, микросистемная техника, медицина и др.

СЗЦТТ уже сотрудничает с такими вузами и институтами как Санкт-Петербургский национальный исследовательский университет информационных технологий, механики и оптики, Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого и Всероссийский научно-исследовательский проектно-конструкторский и технологический институт электромашиностроения.